連續4週全日本票房冠軍！ 2013暑假超級強檔！！
極度危險的緊急任務！
目標為•••日本全國！
全國緊急事件發生！
「緊急接近中！這艘船可能被放置了爆破物．．．」 京都．舞鶴港灣的晨曦，出現了一艘身分不明的船隻，遺留在船上的檔案及物品經查發現全部皆非來自日本國內。此一新聞的報導，讓日本全國陷入恐慌。
突然被襲擊的日本海上防衛艦「神盾艦」！ 柯南、小蘭、毛利小五郎以及少年偵探團等人，一同參加了神盾艦的體驗航海活動，在日本海上自衛隊員的示範下，親眼見識到氣勢非凡的空中對戰演習。
這時候，神秘的敵軍突然來襲，演習旋即變成了真實的激烈對戰！小蘭與少年偵探團成員看到眼前的這一切，感到十分恐懼與不安。
在海上自衛隊冷靜的應對處理下，戰況總算平息了下來，但是卻摸不清敵人的目的為何。
在此同時，艦內發現了一隻自衛隊員的左手殘肢，那隻手上戴了一只時間停滯在5:30 AM的手錶．．．！
在如此不尋常的事態下，大阪府警方與京都府警方也緊急出動直升機前來現場，協力展開調查。
而實際上並未登艦的女性自衛官－－藤井七海，也在此時謎樣般的現身．．． 危險度１５０％！！
與看不見的敵人進行諜報戰！憑藉著犯人追蹤眼鏡、最新偵探工具「衛星電話手錶」，以及在大阪的平次、和葉的協助下，柯南與灰原、阿笠博士對此一事件展開調查，赫然發現某國的間諜「Ｘ」竟然正潛伏在艦上！
究竟間諜「Ｘ」是誰？自衛隊員的左手、謎樣般的女性自衛官，他們之間又有甚麼關聯存在呢？在這艘神盾艦上所發生的事件，其實正蘊藏著一樁牽連日本全國的巨大陰謀！
DVD-9
VIDEO：16：9
本篇：約110分
字幕：中文字幕(可關閉)
發音：
日語發音 國語發音
音效格式：
1.Dolby Digital 5.1ch (日語)
2.DTS 5.1ch (日語)
3.Dolby Digital 2ch (國語)