第拾參話 「使徒入侵」
中心教義區出現了微量的侵蝕，但那卻正是第11使徒「恐怖天使」的傑作；污染區域不斷擴大，最後使徒終於侵入了超級電腦MAGI。律子主張使用促進使徒進化，使其自我毀滅的作戰方略，並隨即為了準備反向入侵開始進行緊急作業。到底是CASPER比較快還是使徒比較快呢？在極度緊繃的作戰過程中，律子緩緩道出MAGI和她母親之間的關係……
第拾肆話 「SEELE，魂之座」
在人類補完委員會的特別召集會議當中，大家回顧了使徒和EVA的戰鬥記錄。真嗣他們的行動真的只不過是按照SEELE的劇本，重現死海文書上的記述嗎？另一方面，在NERV本部進行的機體互換試驗中，真嗣駕駛的零號機突然暴走，嚴重破壞了本部設施。——EVA、傀儡插入栓、亞當計畫、朗基努斯之槍等等，故事中的謎團變得更多也更撲朔迷離了。
第拾伍話 「謊言與沉默」
這一天，真嗣和父親一起佇立在母親的墳前，而美里則是與加持他們一起去參加朋友的結婚典禮。在喝過第三攤之後，美里在回家路上吐露自己的心聲，為了打斷她那帶著自虐色彩的言語，加持於是用吻堵住了美里的嘴唇……。隔日，當加持潛入中心教義區進行秘密偵查時，美里突然拿槍抵在他背後；在那扇門背後，他們兩人目睹了驚人的事實……
第拾陸話 「致死之病，然後...」
因為與EVA的同步測試得到很高的數值，真嗣開始有了自信，並在跟使徒的戰鬥中接下了前鋒的任務；然而第12使徒「夜之天使」還是毫不客氣地，把驕傲的真嗣以及初號機吞進了被稱為「狄拉克之海」的虛數空間。真嗣在封閉的空間中與另一個自己對峙著，經歷內心宇宙的糾葛苦悶後，他所到達的地方將會是絕望？還是會有其他的結果呢？
影片分級：保護級
片長：94分鐘
日語發音中文字幕
音訊格式：Dolby 2ch/DTS 5.1ch
影像格式：4：3
詳細資料
發行：銘成
類別：DVD
保護級 / 第 3 區
片長：約94分鐘 / 螢幕比例：4:3
字幕：中 / 語言發音：日
影音格式：Dolby Digital